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创新研究群体项目获得者

俞洋  博士 研究员 博士生导师  

中科院生物物理所,中国科学院核酸生物学重点实验室,研究组长

研究方向:非编码核酸调控表观遗传的生物学功能和分子机制

电子邮件:yuyang@ibp.ac.cn

电       话:010-64881041

通讯地址:北京市朝阳区大屯路15号(100101)

英文版个人网页:http://english.ibp.cas.cn/faculty/index_18316.html?json=http://www.ibp.cas.cn/sourcedb_ibp_cas/cn/ibpexport/EN_xsszmX_Y/202005/t20200519_5582962.json

 

简       历:

  1998 - 2002 武汉大学病毒学,学士

  2002 - 2007 美国凯斯西储大学生物化学,Timothy Nilsen Lab,博士

  2007 - 2010 美国凯斯西储大学RNA Center for Molecular Biology,博士后

  2010 - 2016 美国冷泉港实验室,Gregory Hannon Lab,博士后

  2016 - 至今 中国科学院生物物理研究所,研究员,博士生导师

获奖及荣誉:

 

社会任职:

 

研究方向:

  本课题组致力于非编码RNA(如piRNA, miRNA和lincRNA)调控表观遗传的生物学功能和作用机制。目前主要关注胚胎早期发育和生殖细胞分化时非编码RNA调控异染色质形成以及其它靶标的分子机制。RNA作为生命起源的核心分子,本身就能够执行多种生物学功能。在不断进化过程中,又演化出丰富多样的新的功能,并几乎参与生物体的每个生命过程。因此,研究RNA不但能够探索生命的本质,也能为未来治疗人类疾病提供重要的线索和靶标。我们欢迎有志于RNA调控表观遗传研究的学生加入我们,共同探究RNA世界的奥秘。

  实验室目前主要研究方向为:

  1. Piwi家族蛋白结合的小非编码RNA(piRNA)的产生和作用机制。人类近一半的基因组序列是转座子(转座子在某种意义上可看成是能在基因组中能跳跃的类似于内源性寄生病毒的DNA元件)。而piRNA通路正是生殖细胞中抵抗转座子的“先天免疫系统”。或者说piRNA是真核生物的“CRISPR”系统。piRNA通路的突变或缺失通常会导致生物体不孕不育。我们主要以果蝇和小鼠为模式生物,充分利用其遗传学优势,结合各种分子生物学,生物化学,生物信息学和化学生物学的方法探索piRNA通路的奥秘。

  2. 动物杂交不育的分子机制。经典的杂交不育例如果蝇中的P-M系统,如果母亲是来自野生的被Pelement侵染的strain,父亲是实验室未被Pelement侵染的strain,它们的子代是正常可育的;而如果母亲是来自实验室的strain,父亲是野生的,它们的子代无法继承来自于野生strain的可抵抗转座子(Pelement)的maternalpiRNA,因而有不育的表型。我们计划以果蝇和小鼠为模式生物,并结合CRISPR筛选,深入研究表观遗传调控杂交不育的分子机制。

  3. 发展新的研究核酸与蛋白,蛋白和蛋白相互作用的高通量生物学方法,并结合合成生物学,单细胞测序技术,CRISPR介导的正向或反相遗传学等各种方法,研究各种重要生命过程生物大分子互作。

承担项目情况:

 

代表论著:

  1. Zhao K.*, Cheng S.*, Miao N.*, Xu P.*, Lu X.*, Zhang Y.*, Wang M., Zhang Y., Yuan X., Liu W., Lu X., Ouyang X., Zhou P., Gu J., Zhang Y., Qiu D., Jin Z., Su C., Peng C. Wang J., Dong M., Wan Y., Ma J., Cheng H., Huang Y.#, Yu Y.# (2019) A Pandas complex adapted for piRNA-guided transposon silencing and heterochromatin formation. Nature Cell Biology, 21(10):1261-1272. bioRxiv608273.

  2. Gu J., Wang M., Yang Y., Qiu D., Zhang Y., Ma J.#, Zhou Y.#, Hannon G.#, Yu Y.# (2018) GoldCLIP: Gel-omitted Ligation-dependent CLIP. GPB, 16 (2): 136-143.

  3. Yu Y., Gu J., Jin Y., Luo Y., Preall J., Ma J., Czech B. and Hannon G.J. (2015) Panoramix enforces piRNA-dependent co-transcriptional silencing. Science, 350 (6258): 339-342.

  4. Vagin, V.*, Yu Y.*,Jankowska A.*, Luo Y., Malone C.D., Harrison E., Rosebrock A., Wakimoto B.T., FagegaltierD., Muerdter F. and Hannon G.J. (2013) Minotaur is critical for primary piRNA biogenesis. RNA, 19(8): 1064-77.

  5. Yu Y., Maroney P.A., Denker J.A., Zhang X.H., Dybkov O., Luhrmann R., Jankowsky E., Chasin L.A. and Nilsen T.W. (2008). Dynamic regulation of alternative splicing by silencers that modulate 5' splice site competition. Cell, 135(7): 1224-36.

专      著:

  Yu Y. and Nilsen T.W. (2009). Mechanisms by which microRNAs regulate gene expression in animal cells.In Regulation of Gene Expression by Small RNAs. Gaur R.K. and Rossi J.J. Eds. CRC Press.

其它论文:

  1. Muerdter F., Guzzardo P.M., Gillis J., Luo Y., Yu Y., Chen C., Fekete R. and Hannon G.J. (2013) A genome-wide RNAi screen draws a genetic framework for transposon control and primary piRNA biogenesis in Drosophila. Mol Cell, 50(5): 736-748.

  2. Maroney P.A., Yu Y., Fisher J. and Nilsen T.W. (2006). Evidence that microRNAs are associated with translating messenger RNAs in human cells. NSMB, 13(12):1102-7.

 

(资料来源:俞洋研究员,2020-03-06)