生物物理研究所的研究系统由六个实验室组成：生物大分子国家重点实验室、脑与认知科学国家重点实验室、中国科学院感染与免疫重点实验室、中国科学院核酸生物学重点实验室、蛋白质与多肽药物所重点实验室、交叉科学所重点实验室。

　　这六个实验室下设88个研究组，共有研究组长88人。

　　 1、 生物大分子国家重点实验室

　　2、 脑与认知科学国家重点实验室

　　3、 中国科学院感染与免疫重点实验室

　　4、 中国科学院核酸生物学重点实验室

　　5、 蛋白质与多肽药物所重点实验室

　　6、 交叉科学所重点实验室

　　生物物理所研究组长总名录

（资料来源：人事处，编撰：科技处，2019-10-21更新）