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  俞洋博士 研究员 博士生导师

  国家青年“千人计划”获得者

  中国科学院生物物理研究所,核酸生物学重点实验室,创新课题组组长

  研究方向:RNA调控表观遗传的生物学功能和分子机制

  电子邮件(E-mail ) yuyang(AT)ibp.ac.cn

  电话(Tel) 010-64881041

  邮政编码 100101

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  简历 & 研究组工作摘要

  2016.12: 入选国家青年千人计划

  2016-今: 中国科学院生物物理研究所,研究员,博士生导师

  2010-2016:美国冷泉港实验室,博士后

  2007-2010:美国凯斯西储大学生物化学,博士后

  2002-2007:美国凯斯西储大学生物化学,博士

  1998-2002:武汉大学病毒学,学

  我们致力于RNA(如piRNA,Xist等)调控表观遗传的生物学功能和作用机制。目前主要关注胚胎早期发育和生殖细胞分化形成时异染色质调控的分子机制。RNA作为生命起源的核心分子,能够执行多种生物学功能。在不断进化过程中,又演化出丰富多样的新机制。RNA几乎参与生物体的每个生命过程。因此,研究RNA不但能够探索生命的本质,也能为未来治疗人类疾病提供重要的线索和靶标。我们欢迎有志于RNA研究的同学和科研工作者加入我们团队,共同探究RNA世界的奥秘。

  实验室目前主要研究方向为:

  1)Piwi家族蛋白结合的小非编码RNA(piRNA)的产生和作用机制。人类近一半的基因组序列是转座子(转座子在某种意义上可看成是能在基因组中跳跃的类似于内源性寄生病毒的DNA元件)。而piRNA通路正是生殖细胞中抵抗转座子的“先天免疫系统”。或者说piRNA是真核生物的CRISPR系统。piRNA通路的突变或缺失通常会导致生物体不孕不育。我们主要以果蝇,蚊子和小鼠为模式生物,结合遗传学,分子生物学,生物化学,生物信息学和化学生物学等方法探索piRNA通路的奥秘。

  2)长非编码RNA(lincRNA)的生物学功能和作用机制。除了Xist,Hotair,H19等经典的长非编码RNA外,近年来又发现了很多新的lincRNA。它们的功能和作用机制几乎是一片未开垦的沃土。

  3)发展解析RNA和蛋白互作以及蛋白和蛋白互作的高通量研究方法。我们利用高通量测序结合酵母双杂交,合成生物学,单细胞分选技术,以及CRISPR介导的正向或反相遗传筛选等方法,研究RNA及表观遗传相关的重要科学问题。

  代表性论文

  1. Zhao K. *, Cheng S. *, Miao N. *, Xu P.*, Lu X.*, Wang M., Zhang Y., Yuan X., Liu W., Lu X., Ouyang X., Zhou P., Gu J., Zhang Y., Qiu D., Wang S., Jin Z., Wan Y., Ma J., Cheng H., Huang Y.#, Yu Y.# (2019) A Pandas complex adapted for piRNA-guided transposon silencing. bioRxiv 608273.

  2. Gu J., Wang M., Yang Y., Qiu D., Zhang Y., Ma J.#, Zhou Y.#, Hannon G.#, Yu Y.# (2018) GoldCLIP: Gel-omitted Ligation-dependent CLIP. GPB, 16 (2): 136-143. (#corresponding author)

  3. Yu Y., Gu J., Jin Y., Luo Y., Preall J., Ma J., Czech B. and Hannon G.J. (2015) Panoramix enforces piRNA-dependent co-transcriptional silencing. Science, 350 (6258): 339-342.

  4. Vagin, V.*, Yu Y.*, Jankowska A.*, Luo Y., Malone C.D.,  Harrison E., Rosebrock A., Wakimoto B.T., Fagegaltier D., Muerdter F. and Hannon G.J.. (2013) Minotaur is critical for primary piRNA biogenesis. RNA,19(8): 1064-77. (* equal contribution).

  5. Muerdter F., Guzzardo P.M., Gillis J., Luo Y., Yu Y., Chen C., Fekete R. and Hannon G.J.. (2013) A genome-wide RNAi screen draws a genetic framework for transposon control and primary piRNA biogenesis in Drosophila. Mol Cell, 50(5): 736-748.

  6. Yu Y., Maroney P.A., Denker J.A., Zhang X.H., Dybkov O., Luhrmann R., Jankowsky E., Chasin L.A. and Nilsen T.W. (2008). Dynamic regulation of alternative splicing by silencers that modulate 5' splice site competition. Cell, 135(7): 1224-36.

  7. Maroney P.A., Yu Y., Fisher J. and Nilsen T.W. (2006). Evidence that microRNAs are associated with translating messenger RNAs in human cells. NSMB. 13(12):1102-7.

  专著

  Yu Y. and Nilsen T.W. (2009). Mechanisms by which microRNAs regulate gene expression in animal cells.In Regulation of Gene Expression by Small RNAs. Gaur R.K. and Rossi J.J. Eds. CRC Press.

  

  资料来源:俞洋研究员,2019-05-13网页更新  

                 
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