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  王江云 博士 研究员 博士生导师 

  国家“杰出青年基金”、中科院“百人计划”获得者

  中科院生物物理所,中国科学院核酸生物学重点实验室,研究组长

  研究方向:生物物理化学、合成生物学及化学生物学

  电子邮件(E-mail) jwang@ibp.ac.cn

  电话(Tel) 010-64887050

  传真(Fax) 010-64871293,邮政编码 100101

  英文版个人网页

  简历 & 研究组工作摘要

  2007-current,中国科学院生物物理研究所,非编码核酸北京市重点实验室研究员

  2003-2007,博士后, 美国Scripps 研究所

  1998-2003,化学博士, 美国Univ. of Illinois at Urbana Champaign

  王江云研究员于2007年获中国科学院百人计划资助到中国科学院生物物理研究所工作,组建了以研究生物物理化学、合成生物学及化学生物学为主要方向的课题组。主要研究内容包括:1. 发展蛋白质及RNA标记的新方法,研究蛋白质及RNA的定位,结构,折叠,以及相互作用。 2. 研究含有金属卟啉和铜离子的蛋白质的结构功能,并在此基础上设计新的金属酶。这些新的方法不仅已经揭示了细胞色素c氧化酶、光合作用中心及细胞骨架组装的重要机理,并且有关国际国内专利经已经转让给Novartis, Ambrx等公司,在药物蛋白修饰上已经有重要应用。课题组于2012年国际评估被评为优秀。

  在研项目:

  科技部973 “表观遗传学的化学生物学研究”,任课题组长。

  科技部973 “基因密码子的分子生物学研究”,任课题骨干。

  中国科学院重点部署项目 “非编码RNA”,任项目首席。

  国家自然科学基金委 “杰出青年基金”,任课题负责人。

  国家自然科学基金委“重大研究计划培育项目”,任课题负责人。

  课题组成员及学生信息

  工作人员:

  刘晓红,青年研究员,Liuxh@moon.ibp.ac.cn 

  李发慧,副研究员,Lifahui@moon.ibp.ac.cn 

  姜丽,副研究员,lijiang@moon.ibp.ac.cn 

  张华,助理研究员,zhanghua@moon.ibp.ac.cn 

  刘鹏程,助理研究员,lpc@moon.ibp.ac.cn

  王天元,助理研究员

  

  在学研究生:

  吕晓璇,毕业于中国科技大学,lvxiaoxuan@moon.ibp.ac.cn 

  朱晓璐,毕业于华中科技大学,zhuxl@moon.ibp.ac.cn 

  汪莉,wangli90@mail.ustc.edu.cn 

  隋龙臻,毕业于北京理工大学,suilongzhen@moon.ibp.ac.cn 

  王晓燕,毕业于武汉大学,wxy421@gmail.com 

  胡诚,毕业于北京大学,hucheng@pku.edu.cn 

  康福英,毕业于兰州大学,kangfuying1990@163.com 

  郭旭祯,毕业于北京理工大学,guoxuzhen14@mails.ucas.ac.cn 

  郝亚洲,毕业于吉林大学,haoyazhou14@mails.ucas.ac.cn 

  杜康,毕业于青岛大学,dukang14@mails.ucas.ac.cn

    

  在学联合培养学生:

  王天元,中国科技大学,tyw1234@mail.ustc.edu.cn 

  杨帆,山东大学,yangfan1357@163.com 

  刘川,山东大学,liuchuan8969@163.com 

  刘琪,山东大学,oiiifet_qiqi@163.com 

  卢家琪,北京大学,lujiaqi@pku.edu.cn 

  尤雪,中国科学院化学研究所,youxue123@iccas.ac.cn

  

  

  王江云研究员非常注重培养学生,积极鼓励学生参加国内外相关学科学术会议,以下是近几年学生参加国内国际会议情况:

  2011年8月在南京举行的第七届中国化学生物学会议参加学生:徐欣仪,杨杰,祈林祥,吕晓璇

  2012年在杭州举行的 "表观遗传学的结构机理研究"2012年交流会参加学生:王天元,吕晓璇

  2013年9月在苏州举行的衰老和疾病的分子机制会议参加学生:杨帆

  2013年9月在上海举行的第八届中国化学生物学会议参加学生:吕晓璇

  2013年10月在合肥举行的第四届“跨学科蛋白质研究”学术讨论会参加学生:王天元,李家松

  2014年3月在日本东京举行的HOPE会议参加学生:周庆

  2014年12月在苏州举行的冷泉港合成生物学会议参加学生:胡诚,汪莉,康福英

  2014年12月在新加坡举行的第三届亚洲化学生物学会议参加学生:吕晓璇

  

  学生获奖情况

  王江云组毕业的及仍在学的优秀的研究生不仅取得了丰硕的科研成果,还收获了一份份荣誉和奖励。迄今为止,已有多名学生获得国家奖学金、中国科学院院长奖学金、光华奖学金、朱李月华优秀博士生奖学金、生物物理所所长奖学金、中国科技大学优秀毕业生、安徽省普通高校品学兼优毕业生等奖学金。

  学生毕业去向

  在顺利获得学位之后,各位同学带着导师的期待,继续迎接着人生的一个又一个的辉煌!

  毕业去向:美国耶鲁大学、香港中文大学、中国科学院微生物研究所、海南神农大丰种业公司、河南农业大学、广东深圳第二医院等。

  研究生的学习生活和科研工作是紧张而艰辛的,但是也是愉快并丰富多彩的。课题组是一个融洽的大家庭,我们有幸聚在这里,共同分享快乐,共同探索科学,共同迈向明天!

  

  代表性论文((*通讯作者, #同等贡献) 

  1. Yu Y#, Liu X#, Wang J*. Expansion of Redox Chemistry in Designer Metalloenzymes. Acc Chem Res. doi: 10.1021/acs.accounts.8b00627. [Epub ahead of print]

  2. Liu X#, Kang F#, Hu C#, Wang L, Xu Z, Zheng D, Gong W, Lu Y, Ma Y, Wang J*. A genetically encoded photosensitizer protein facilitates the rational design of a miniature photocatalytic CO2-reducing enzyme. Nat Chem. 2018, 10 (12):1201-1206. doi: 10.1038/s41557-018-0150-4.

  3. Mu Z, Zou Z, Yang Y, Wang W, Xu Y, Huang J, Cai R, Liu Y, Mo Y, Wang B, Dang Y, Li Y, Liu Y, Jiang Y, Tan Q, Liu X, Hu C, Li H, Wei S, Lou C, Yu Y, Wang J*. A genetically engineered Escherichia coli that senses and degrades tetracycline antibiotic residue. Synth Syst Biotechnol. 2018, 3(3):196-203. doi: 10.1016/j.synbio.2018.05.001.

  4. Dong J, Li F, Gao F, Wei J, Lin Y, Zhang Y, Lou J, Liu G, Dong Y, Liu L, Liu H, Wang J, Gong W*. Structure of tRNA-Modifying Enzyme TiaS and Motions of Its Substrate Binding Zinc Ribbon. J Mol Biol. 2018, 430(21):4183-4194. doi: 10.1016/j.jmb.2018.08.015.

  5. Yang F#, Xiao P#, Qu CX#, Liu Q#, Wang LY, Liu ZX, He QT, Liu C, Xu JY, Li RR, Li MJ, Li Q, Guo XZ, Yang ZY, He DF, Yi F, Ruan K, Shen YM, Yu X, Sun JP*, Wang J*. Allosteric mechanisms underlie GPCR signaling to SH3-domain proteins through arrestin. Nat Chem Biol. 2018, 14(9):876-886. doi: 10.1038/s41589-018-0115-3. 

  6. Wang L#, Chen X#, Guo X#, Li J, Liu Q, Kang F, Wang X, Hu C, Liu H, Gong W, Zhuang W, Liu X*, Wang J*. Significant expansion and red-shifting of fluorescent protein chromophore determined through computational design and genetic code expansion. Biophys Rep. 2018, 4(5):273-285. doi: 10.1007/s41048-018-0073-z.

  7. Zhang J#, Wang L#, Zhang J, Zhu J, Pan X, Cui Z, Wang J*, Fang W*, Li Y*. Identifying and Modulating Accidental Fermi Resonance: 2D IR and DFT Study of 4-Azido-l-phenylalanine. J Phys Chem B. 2018, 122(34):8122-8133. doi: 10.1021/acs.jpcb.8b03887.

  8. Li J, Griffith WP, Davis I, Shin I, Wang J, Li F, Wang Y, Wherritt DJ, Liu A*. Cleavage of a carbon-fluorine bond by an engineered cysteine dioxygenase. Nat Chem Biol. 2018, 14(9):853-860. doi: 10.1038/s41589-018-0085-5.

  9. Zhang F#, Zhou Q#, Yang G, An L, Li F*, Wang J*. A genetically encoded 19F NMR probe for lysine acetylation. Chem Commun (Camb). 2018, 54(31):3879-3882. doi: 10.1039/c7cc09825a.

  10. Chen L, Naowarojna N, Song H, Wang S, Wang J, Deng Z, Zhao C, Liu P*. Use of a Tyrosine Analogue To Modulate the Two Activities of a Nonheme Iron Enzyme OvoA in Ovothiol Biosynthesis, Cysteine Oxidation versus Oxidative C-S Bond Formation. J Am Chem Soc. 2018, 140(13):4604-4612. doi: 10.1021/jacs.7b13628.

  11. Yu Y, Hu C, Xia L, and Wang J*. Artificial Metalloenzyme Design with Unnatural Amino Acids and Non-Native Cofactors. ACS Catal. 2018, 8 (3):1851–1863 doi: 10.1021/acscatal.7b03754.

  12. Pan Y, Zhang H, Zheng Y, Zhou J, Yuan J, Yu Y, Wang J*. Resveratrol Exerts Antioxidant Effects by Activating SIRT2 To Deacetylate Prx1. Biochemistry. 2017, 56(48):6325-6328. doi: 10.1021/acs.biochem.7b00859.

  13. Lu J#, Zhang H#, Chen X#, Zou Y, Li J, Wang L, Wu M, Zang J, Yu Y, Zhuang W*, Xia Q*, Wang J*. A small molecule activator of SIRT3 promotes deacetylation and activation of manganese superoxide dismutase. Free Radic Biol Med. 2017, 112:287-297. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2017.07.012.

  14. Hu C#, Yu Y#, Wang J*. Improving artificial metalloenzymes' activity by optimizing electron transfer. Chem Commun (Camb). 2017, 53(30):4173-4186. doi: 10.1039/c6cc09921a.

  15. Yang F, Yu X, Liu C, Qu CX, Gong Z, Liu HD, Li FH, Wang HM, He DF, Yi F, Song C, Tian CL, Xiao KH, Wang JY*, Sun JP*. Phospho-selective mechanisms of arrestin conformations and functions revealed by unnatural amino acid incorporation and 19F-NMR. Nat Commun. 2015, 6:8202. doi: 10.1038/ncomms9202.

  16. Yang Y#, Zhou Q#, Wang L#, Liu X, Zhang W, Hu M, Dong J, Li J, Xiaoxuan L, Ouyang H, Li H, Gao F, Gong W, Lu Y*, Wang J*. Significant Improvement of Oxidase Activity through the Genetic Incorporation of a Redox-active Unnatural Amino Acid. Chem Sci. 2015, 6(7):3881-3885. doi: 10.1039/C5SC01126D

  17. Yu Y#, Cui C#, Liu X#, Petrik ID, Wang J*, Lu Y*. A Designed Metalloenzyme Achieving the Catalytic Rate of a Native Enzyme. J Am Chem Soc. 2015, 137(36):11570-3. doi: 10.1021/jacs.5b07119.

  18. Yu Y, Hu C, Liu X, Wang J*. Synthetic Model of the Oxygen-Evolving Center: Photosystem II under the Spotlight. Chembiochem. 2015, 16(14):1981-3. doi: 10.1002/cbic.201500302.

  19. He T, Gershenson A, Eyles SJ, Lee YJ, Liu WR, Wang J, Gao J, Roberts MF*. Fluorinated Aromatic Amino Acids Distinguish Cation-π Interactions from Membrane Insertion. J Biol Chem. 2015, 290(31):19334-42. doi: 10.1074/jbc.M115.668343.

  20. Lv X#, Yu Y#, Zhou M, Hu C, Gao F, Li J, Liu X, Deng K, Zheng P, Gong W, Xia A*, Wang J*. Ultrafast photoinduced electron transfer in green fluorescent protein bearing a genetically encoded electron acceptor. J Am Chem Soc. 2015, 137(23):7270-3. doi: 10.1021/jacs.5b03652.

  21. Wang T, Zhou Q*, Li F, Yu Y, Yin X*, Wang J*. Genetic Incorporation of N(ε)-Formyllysine, a New Histone Post-translational Modification. Chembiochem. 2015, 16(10):1440-2. doi: 10.1002/cbic.201500170.  

  22. Zheng Y, Yu F, Wu Y, Si L, Xu H, Zhang C, Xia Q, Xiao S, Wang Q, He Q, Chen P, Wang J, Taira K, Zhang L, Zhou D*. Broadening the versatility of lentiviral vectors as a tool in nucleic acid research via genetic code expansion. Nucleic Acids Res. 2015, 43(11):e73. doi: 10.1093/nar/gkv202.

  23. Li F#, Dong J#, Hu X#, Gong W, Li J, Shen J, Tian H, Wang J*. A covalent approach for site-specific RNA labeling in Mammalian cells. Angew Chem Int Ed Engl. 2015, 54(15):4597-602. doi: 10.1002/anie.201410433.

  24. Yu Y#, Lv X#, Li J, Zhou Q, Cui C, Hosseinzadeh P, Mukherjee A, Nilges MJ, Wang J*, Lu Y*. Defining the role of tyrosine and rational tuning of oxidase activity by genetic incorporation of unnatural tyrosine analogs. J Am Chem Soc. 2015 Apr 15;137(14):4594-7. doi: 10.1021/ja5109936.

  25. Liu X#, Jiang L#, Li J#, Wang L, Yu Y, Zhou Q, Lv X, Gong W, Lu Y, Wang J*. Significant expansion of fluorescent protein sensing ability through the genetic incorporation of superior photo-induced electron-transfer quenchers. J Am Chem Soc. 2014, 136(38):13094-7. doi: 10.1021/ja505219r.

  26. Pan Y, Jin JH, Yu Y*, Wang J*. Significant enhancement of hPrx1 chaperone activity through lysine acetylation. Chembiochem. 2014, 15(12):1773-6. doi: 10.1002/cbic.201402164.

  27. Hu C#, Chan SI#, Sawyer EB#, Yu Y, Wang J*. Metalloprotein design using genetic code expansion. Chem Soc Rev. 2014, 43(18):6498-510. doi: 10.1039/c4cs00018h.

  28. Wu FC#, Zhang H#, Zhou Q, Wu M, Ballard Z, Tian Y, Wang JY*, Niu ZW*, and Huang Y. Expanding the genetic code for site-specific labelling of tobacco mosaic virus coat protein and building biotin-functionalized virus-like particles. Chem. Commun. 2014, 50, 4007-4009. doi: 10.1039/c3cc49137d.

  29. Bi K#, Zheng Y#, Gao F, Dong J, Wang J, Wang Y*, Gong W*. Crystal structure of E. coli arginyl-tRNA synthetase and ligand binding studies revealed key residues in arginine recognition. Protein Cell. 2014, 5(2):151-9. doi: 10.1007/s13238-013-0012-1.

  30. Lin YW*, Wang JY* & Lu Y*. Functional tuning and expanding of myoglobin by rational protein design. Science China Chemistry. 2014, 57(3): 346-355. doi: 10.1007/s11426-014-5063-5
  31. Zheng Y, Lv X, Wang J*. A genetically encoded sulfotyrosine for VHR function research. Protein Cell. 2013, 4(10):731-4. doi: 10.1007/s13238-013-3907-y.

  32. Lin YW, Wang J*. Structure and function of heme proteins in non-native states: a mini-review. J Inorg Biochem. 2013, 129:162-71. doi: 10.1016/j.jinorgbio.2013.07.023.

  33. Li F#, Zhang H#, Sun Y#, Pan Y#, Zhou J, Wang J*. Expanding the genetic code for photoclick chemistry in E. coli, mammalian cells, and A. thaliana. Angew Chem Int Ed Engl. 2013, 52(37):9700-4. doi: 10.1002/anie.201303477.

  34. Lin YW, Sawyer EB*, Wang J*. Rational heme protein design: all roads lead to Rome. Chem Asian J. 2013, 8(11):2534-44. doi: 10.1002/asia.201300291.

  35. Liu X#, Li J#, Hu C, Zhou Q, Zhang W, Hu M, Zhou J, Wang J*. Significant expansion of the fluorescent protein chromophore through the genetic incorporation of a metal-chelating unnatural amino acid. Angew Chem Int Ed Engl. 2013, 52(18):4805-4809. doi: 10.1002/anie.201301307.

  36. Li F#, Shi P#, Li J#, Yang F, Wang T, Zhang W, Gao F, Ding W, Li D, Li J, Xiong Y, Sun J, Gong W*, Tian C, Wang J*. A genetically encoded 19F NMR probe for tyrosine phosphorylation. Angew Chem Int Ed Engl. 2013, 52(14):3958-62. doi: 10.1002/anie.201300463.

  37. Xu X, Hu X*, Wang J*. A new synthetic protocol for coumarin amino acid. Beilstein J Org Chem. 2013, 9:254-9. doi: 10.3762/bjoc.9.30. 

  38. Zhou Q#, Hu M#, Zhang W#, Jiang L, Perrett S, Zhou J, Wang J*. Probing the function of the Tyr-Cys cross-link in metalloenzymes by the genetic incorporation of 3-methylthiotyrosine. Angew Chem Int Ed Engl. 2013, 52(4):1203-7. doi: 10.1002/anie.201207229.

  39. Yu Z#, Pan Y#, Wang Z, Wang J*, Lin Q*. Genetically encoded cyclopropene directs rapid, photoclick-chemistry-mediated protein labeling in mammalian cells. Angew Chem Int Ed Engl. 2012, 51(42):10600-4. doi: 10.1002/anie.201205352.

  40. Liu X#, Li J#, Dong J#, Hu C, Gong W*, Wang J*. Genetic incorporation of a metal-chelating amino acid as a probe for protein electron transfer. Angew Chem Int Ed Engl. 2012, 51(41):10261-5. doi: 10.1002/anie.201204962.

  41. Hua T#, Wu D#, Ding W, Wang J, Shaw N*, Liu ZJ*. Studies of human 2,4-dienoyl CoA reductase shed new light on peroxisomal β-oxidation of unsaturated fatty acids. J Biol Chem. 2012, 287(34):28956-65. doi: 10.1074/jbc.M112.385351.

  42. Liu X#, Yu Y#, Hu C, Zhang W, Lu Y*, Wang J*. Significant increase of oxidase activity through the genetic incorporation of a tyrosine-histidine cross-link in a myoglobin model of heme-copper oxidase. Angew Chem Int Ed Engl. 2012, 51(18):4312-6. doi: 10.1002/anie.201108756.

  43. Charbon G, Wang J, Brustad E, Schultz PG, Horwich AL, Jacobs-Wagner C, Chapman E*. Localization of GroEL determined by in vivo incorporation of a fluorescent amino acid. Bioorg Med Chem Lett. 2011, 21(20):6067-70. doi: 10.1016/j.bmcl.2011.08.057.

  44. Charbon G, Brustad E, Scott KA, Wang J, L?bner-Olesen A, Schultz PG, Jacobs-Wagner C, Chapman E*. Subcellular protein localization by using a genetically encoded fluorescent amino acid. Chembiochem. 2011, 12(12):1818-21. doi: 10.1002/cbic.201100282.

  45. Wang J*, Zhang W, Song W, Wang Y, Yu Z, Li J, Wu M, Wang L, Zang J, Lin Q*. A biosynthetic route to photoclick chemistry on proteins. J Am Chem Soc. 2010, 132 (42) : 14812 -8. doi: 10.1021/ja104350y.

  46. Mills JH, Lee HS, Liu CC, Wang J, Schultz PG*. A genetically encoded direct sensor of antibody-antigen interactions. Chembiochem. 2009, 10(13):2162-4. doi: 10.1002/cbic.200900254.

  47. Peters FB, Brock A, Wang J, Schultz PG*. Photocleavage of the polypeptide backbone by 2-nitrophenylalanine. Chem Biol. 2009, 16(2):148-52. doi: 10.1016/j.chembiol.2009.01.013.

  48. Guo J, Wang J, Lee JS, Schultz PG*. Site-specific incorporation of methyl- and acetyl-lysine analogues into recombinant proteins. Angew Chem Int Ed Engl. 2008, 47(34):6399-401. doi: 10.1002/anie.200802336. No abstract available.

  49. Guo J#, Wang J#, Anderson JC, Schultz PG*. Addition of an alpha-hydroxy acid to the genetic code of bacteria. Angew Chem Int Ed Engl. 2008, 47(4):722-5. doi: 10.1002/anie.200704074

  50. Wang J, Rosenblatt MM, Suslick KS*. NMR structures of peptide--RuII(porphyrin) complexes. J Am Chem Soc. 2007, 129(46):14124-5. doi: 10.1021/ja075532v

  51. Wang J, Schiller SM, Schultz PG*. A biosynthetic route to dehydroalanine-containing proteins.  Angew Chem Int Ed Engl. 2007, 46(36):6849-51. doi: 10.1002/anie.200702305

  52. Wang J, Xie J, Schultz PG*. A genetically encoded fluorescent amino acid. J Am Chem Soc. 2006, 128(27):8738-9. doi: 10.1021/ja062666k

  53. Rosenblatt MM#, Wang J#, Suslick KS*. De novo designed cyclic-peptide heme complexes. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003, 100(23):13140-5. doi: 10.1073/pnas.2231273100 

  54. Wang J, Luthey-Schulten ZA, Suslick KS*. Is the olfactory receptor a metalloprotein? Proc Natl Acad Sci U S A. 2003, 100(6):3035-9. doi: 10.1073/pnas.262792899

   

  资料来源:王江云研究员,2019-03-12  

          
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