1月5-10日，生物物理所组织基础研究国际评估，51位PI参加。

1月10日，徐涛、纪伟团队研究成果“干涉单分子定位显微镜”入选2021年度中国生命科学十大进展。

4月1日，柳振峰任生物物理所副所长。

8月，生物物理所“全人工合成细胞”科研项目入选中国科学院基础研究领域青年团队计划。

9月，生物物理所科学研究平台党支部、脑与认知科学国家重点实验室研究生党支部被授予“中央和国家机关‘四强’党支部”荣誉称号。

9月6日，生物物理所“生物大分子药物创新研发平台”纳入中国科学院“十四五”科教基础设施项目建设规划。

9月16日，生物大分子重点实验室组建方案经院党组会议审议通过，批准启动建设。

9月17日，王祥喜获“谈家桢生命科学创新奖”。

10月26日，中国科学院国家重点实验室体系重组专项工作组审议通过生物物理所“表观遗传调控与干预全国重点实验室组建方案”。

11月3日，生物物理所在怀柔举办“多模态跨尺度生物医学成像设施”工程竣工仪式。

11月3日，生物物理所召开领导班子任期考核会议。

11月12日，王祥喜获第十七届中国青年科技奖。