2005年
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3 月 生物物理所在“中国科学院视觉信息加工重点实验室”、“中国科学院研究生院认知科学重点实验室”和中国科学院心理研究所“心理健康重点实验室”的基础上,组建了“脑与认知科学国家重点实验室”,建设计划获得科学技术部批准。
5 月 承办中国科学院第一届公众科学日开幕式活动。

6 月 24 日 中国生物物理学会承办的第三届天然抗氧化剂分子机理与健康暨第二届亚洲自由基学术大会在上海召开,赵保路任会议主席。
7 月 举办第一届生命科学希望之星夏令营活动。

7 月 30 日 感染与免疫学研究中心成立。

8 月 12 日 诺贝尔化学奖获得者Kurt Wüthrich来访,并作学术报告。
8 月 27 日 饶子和当选国际纯粹与应用生物物理联合会 (IUPAB) 理事会理事。
9 月 13 日 中国生物物理学会承办的首届国际生物经济高层论坛基础生命科学分会在生物物理所举行,饶子和任会议主席。
10 月 19 日 诺贝尔化学奖获得者田中耕一来访。

10月25日 瑞典生物技术代表团来访,其中三位诺贝尔奖获得者Jan Carlstedt-Duke 、Ingemar Ernberg和Bertil Fredholm随同代表团访问研究所。
11月13日 王大成、常文瑞当选为中国科学院院士。
11月 王志珍当选为第三世界科学院院士。
12 月 8 日 王志珍当选为九三学社中央副主席。
12月27日 蛋白质科学研究平台通过院计划局验收。王志珍获何梁何利科学与技术进步奖。
常文瑞获中国科学院杰出科技成就奖个人奖。
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