研究所积极实施国际交流与合作战略,着力推进与国际一流研究机构建立长期稳定的战略合作伙伴关系。开展包括共建联合实验室、人才互访、研究生联合培养、科研项目联合攻关等实质性合作;积极建议、申请和承担国际合作重大项目,组织、推荐研究所科学家到国际学术机构任职,不断提升研究所的国际学术地位。

重大学术会议:
2005年 5月重庆:第十二届国际生物流变学大会暨第五届国际临床血液流变学大会
2005年 6月上海:第三届天然抗氧化剂——分子机理和健康作用国际研讨会
2005年11月北京:第五届蛋白质科学国际会议
2006年10月北京:第四届国际结构基因组学大会
2006年11月北京:第三届亚大生物学大会
2006年5月,中国科学院-日本东京大学“结构病毒学与免疫学实验室”成立;
2006年6月,中国科学院生物物理研究所-通用电气(中国)医疗集团“生命科学示范实验室”成立。