中科院生物物理研究所在中科院蛋白质科学研究平台二期建设（2007-2011年）当中重点发展了生物显微三维成像技术，建成了具有国际一流水平的生物成像中心。该中心定位于生命科学研究前沿，致力于实现对生物学对象从纳观尺度到介观尺度的高分辨率三维成像技术，通过对生物超微高分辨率三维结构的研究来回答生命科学的关键问题。目前，该中心集成了超分辨率光学显微技术、低温电子显微技术、三维重构技术、低温扫描微加工技术、单分子荧光成像技术、原子力显微技术、光电关联显微成像技术以及一系列生物显微成像样品技术，并承担了北京及周边地区生物显微成像技术服务工作，极大促进了相关生命科学前沿研究的进展，成为我国生命科学基础研究的重要支撑平台。