2024年底,《我是刑警》在各大平台上映,其中有一个案件是"良城连环奸杀案",警方通过DNA分析技术,在DNA数据库中比中某一个家族后进行排查,成功锁定了真凶。其实,DNA分析技术除了可以帮助确定命案凶手,它还广泛应用于寻亲打拐(即打击妇女儿童拐卖)、失踪人口/灾难受害者身份认定以及各类亲缘关系鉴定等,这些都是法医物证学的应用场景。那么,什么是DNA分析技术?DNA分析常用的方法有哪些?DNA分析的结果如何解读?带着这些问题,我们一起走进法医物证学的世界。
常用的遗传标记
DNA又称为脱氧核糖核苷酸,包含A、T、C、G四种碱基。不同个体DNA序列排列方式存在一定的差异,我们可以将这些有差异的DNA序列理解为遗传标记。法医学家通常通过检测和分析遗传标记,揭示其中的个体、家族、群体等相关信息。
遗传标记分类
目前,在法医物证学中常用的遗传标记有短串联重复序列(short tandem repeat,STR)、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和插入/缺失多态性(insertion/deletion polymorphism,InDel)等[1]。
STR是法医学中个体识别和亲子鉴定最常用的一类遗传标记。全球各个国家DNA数据库都是基于STR数据构建,已为公检法司系统立下了一系列赫赫战功。STR是指基因组中由2~6个核苷酸构成,重复次数可达5~60次的DNA片段。
图1显示的是一个STR遗传标记示意图,不同行的序列展示了不同个体的STR序列。图中TATC是该STR的核心重复单位,其重复次数一般记为等位基因的长度分型数值(即该STR核心重复区有几个TATC,则等位基因分型就是几)。例如,图1中第一行序列TATC重复了5次,等位基因即为5,第二行序列TATC重复了8次,等位基因是8。

图1 STR示意图
图2给出了单一样本检测的STR分型结果,尖峰下面的数字是STR基因座的等位基因。例如,D3S1358基因座,存在17和18两个峰,分型结果记为17/18;CSF1PO基因座,存在12一个峰,分型结果记为12/12。

图2 样本2800M的STR分型图谱
SNP是基因组中单个核苷酸变异引起DNA序列多态性的一种遗传标记。图3显示的是SNP示意图。对SNP而言,它在人群中主要表现为一个碱基的差异,如A/T/C/G。

图3 SNP示意图
InDel是指基因组中随机插入或缺失一段DNA片段所形成的一种遗传标记。图4显示的是InDel遗传标记示意图,从图中可以看到,相比个体2,个体1的DNA片段中插入TGTCT这段序列。因此,InDel在人群中表现的变异类型有插入和缺失这两类。

图4 InDel示意图
DNA遗传标记检测方法
毛细管电泳技术是在电场的作用下,不同的DNA分子在电泳介质中表现出不同的电泳速率:小片段DNA分子的电泳速率要快于大片段,当DNA分子经过检测窗口时,其经过的时间会被检测器捕获,在计算机上生成峰图,对应遗传标记的等位基因。目前,毛细管电泳平台在法医物证学研究中通常被用于检测STR、InDel等遗传标记,是法医物证学中最常用的检测技术。
二代测序(next generation sequencing,NGS)是法医物证学领域的新型核酸检测技术。它以合成测序为核心技术,通常采用PCR的方式进行文库构建,然后在测序芯片上进行待测DNA片段的序列分析。NGS在DNA分析中具有高通量、高集成度、精细化检测等优势,可获得长度多态性和序列多态性信息,可同时检测多种类型的遗传标记(STR、SNP、InDel和甲基化等),尤其可适用于微量、降解、混合等疑难检材的检验,不仅可用于个体识别,也可用于推测个体的外貌特征、族群来源以及年龄等[2-5]。
DNA检测技术在法医学中的应用
在法医物证学中,个体识别是指通过比较两个样本的遗传分型,如ABO血型、STR基因型等,判断两个样本是否来自于同一个个体。例如,刑事技术警察将案发现场发现的血痕样本提取DNA,通过检测STR遗传标记获得样本的STR分型(通常检测20~30个STR遗传标记),并把检测的结果上传到国家DNA数据库,如果在数据库中发现匹配的个体,则基本上可以认为现场检材是由这个个体所留。
亲子鉴定是通过检测人类的遗传标记(如STR),基于遗传规律分析对有争议的父母和子女血缘关系鉴定。亲子鉴定涉及的对象有争议的父亲,又称为被控父亲(alleged father,AF),有争议的母亲,又称为被控母亲(alleged mother,AM)和需要鉴定的孩子(children,C)。此外,生父或者生母通常以F或者M进行表示。
亲子鉴定通常分为两类,三联体亲子鉴定和二联体亲子鉴定。其中,三联体亲子鉴定是生母/父、有争议父亲/母亲和孩子组成的是三联体亲子鉴定;二联体亲子鉴定是有争议父亲/母亲和孩子构成的是二联体亲子鉴定。二者的主要区别是三联体中生父或者生母和孩子的关系是明确的,需要判断另一争议方和孩子的亲缘关系。
亲子鉴定的基本原理可以概括为以下两点:在肯定孩子的某个等位基因是来自于生父/生母,而有争议的男子/女子无该等位基因,不符合遗传规律,支持排除他们具有亲子关系;在肯定孩子的某个等位基因来自于生父/生母,有争议的男子/女子有该等位基因,符合遗传规律,不能排除他们具有亲子关系。
图5显示了三联体和二联体STR遗传标记的检测结果。对于三联体的分析结果,在D5S818基因座上,生母(M)的基因型是11/12,孩子(C)的基因型是12/13,通过遗传规律分析,可以发现孩子的12等位基因是来自生母,表明孩子的13等位基因属于生父基因;对于AF,他在D5S818基因座上的基因型是11/11,不含有生父基因13,表明在D5S818基因座上不符合遗传规律,支持排除父权,即支持该男子不是孩子的生物学父亲(图5a)。对于二联体,在D3S1358位点上,被控男子(AF)的基因型是17/17,孩子(C)的基因型是15/15,AF无孩子的等位基因15,不符合遗传规律,支持排除父权(图5b)。
对于亲子鉴定,任何时候都不能仅根据1~2个遗传标记不符合遗传规律,就排除父权或母权。因为,遗传标记从亲代传递给子代的过程中,它们可能会发生突变,导致亲子代间出现不符合遗传规律的情况。

图5 三联体(a)和二联体(b)STR的检测结果
除了常规的亲子鉴定,还有全同胞、半同胞、祖孙、姑侄和堂兄弟等亲缘关系鉴定。对于这些亲缘关系鉴定,也是根据遗传标记的检测结果判断他们是否符合遗传规律,并结合统计学计算,确定他们的亲缘关系[6]。法医遗传系谱学,又称为侦查系谱学,是一种用于解决疑难复杂亲缘关系的技术。法医遗传系谱学主要通过检测大量的SNP位点,根据不同个体在SNP位点上的共祖片段长度,用于推测不同个体间的多级亲缘关系,目前在法医学实践中可实现9级亲缘关系的推测[7]。
展望
近年来,随着检测技术尤其是高通量测序技术的不断发展,法医物证学中对检材的检测从DNA遗传标记不断扩展更多类型分子标记,如RNA、DNA甲基化、16S rRNA和蛋白质等,进一步深入挖掘现场检材所蕴含的信息。法医物证学的研究方向也扩展至更多领域,为解决更多复杂问题提供科技支持,如现场检材的年龄预测、组织属性推断、外貌特征刻画、生物地理来源解析和环境样本的溯源研究(详情请点击阅读原文)等[8-12],为案件侦查提供更丰富的线索,为诉讼提供更强力的证据支撑,为平安中国建设贡献公安新质战斗力。
参考文献
[1] Haddrill P R. Developments in forensic DNA analysis. Emerg Top Life Sci,2021,5(3):381-393
[2] Børsting C,Morling N. Next generation sequencing and its applications in forensic genetics. Forensic Sci Int Genet,2015,18: 78-89
[3] 王乐,叶健,白雪,等. 二代测序技术及其在法医遗传学中的应用. 刑事技术,2015(5):353-358
[4] 张驰,郭立亮,周轲,等. 运用法医学二代测序技术侦破19年久冷案. 刑事技术,2022,47(1):100-106
[5] 张驰,康克莱,李蓓,等. 二代测序Y-STR序列多态性之"折叠序列"变异助力侦破21年冷案. 刑事技术,2024,49(6):639-644
[6] 李燃,孙宏钰. 法医学亲缘关系鉴定方法和研究热点. 法医学杂志,2023,39(3):231-239
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[12] 杨琪,康克莱,梅宏成,等. 环境DNA检验及地域来源推断研究进展. 中国法医学杂志,2024,39(3):349-356
作者简介
靳小业:公安部鉴定中心和中国科学院生态环境研究中心联合培养博士后,研究方向:法医遗传学
康克莱:公安部鉴定中心警务技术中级,研究方向:法医遗传学
王 乐:公安部鉴定中心警务技术正高级,研究方向:法医遗传学
(作者:靳小业、康克莱、王乐)
(本文来源于公众号:生物化学与生物物理进展)
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